Zur Stiftskirchengemeinde gehören 3 Pfarrbezirke, deren Pfarrerinnen und Pfarrer miteinander im Team zusammenarbeiten. Das bedeutet, dass manche Arbeiten pfarrbezirksübergreifend getätigt werden.
Das Pfarramt 1 ist mit der Dekansfunktion verbunden. Seit 1.Mai 2004 ist Dekanin Angelika Keller die Amtsinhaberin. Das Pfarramt 2 wird von Pfarrer Matthias Jung geleitet, das Pfarramt 3 von Pfarrer Dr. Ingo Holzapfel.